PYMOL
- PyMOL is a molecular graphics system with an embedded Python interpreter designed for real-time visualization and rapid generation of high-quality molecular graphics images and animations. It can also perform many other valuable tasks (such as editing PDB files) to assist you in your research.
- Dengan menggunakan aplikasi ini kita akan dengan mudah mengetahui bentuk molekul, Van der Walls radius, hingga mesh yang dimiliki oleh suatu molekul.
Berikut cara mudahnya :
1. Pertama kita harus membuka aplikasinya, akan muncul 2 tampilan yaitu Molecular Graphic System dan Pymol Viewer.
2. Klik toolbar build pada Molecular Graphic System , akan muncul banyak pilihan, missal kita pilih fitur Residue → Alanine.
3. kemudian
apabila anda ingin mengubah-ubah tampilnnya kita bisa memilih
fitur-fitur yang ada di sebelah kanan, untuk mengetahui formal charge
kita bisa pilih fitur L-toolbar → other properties →formal charge
4. Jika ingin mengetahui Van der Walls radius tinggal pilih L-toolbar → vdw radius
5. Untuk mengetahui symbols pilih L-toolbar → element symbol
6. Lalu pilih S-toolbar → dots
7. Selanjutnya view dan kemudian Orient
Selamat Mencoba...
Semoga Bermanfaat... :)
0 Comments:
Posting Komentar